MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Ruegeria sp. TM1040 plasmid unnamed

Total Repeats: 1979

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_008042	CAA	2	6	31	36	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	99077903
2	NC_008042	CGAC	2	8	88	95	25 %	0 %	25 %	50 %	99077903
3	NC_008042	GAGG	2	8	99	106	25 %	0 %	75 %	0 %	99077903
4	NC_008042	AGC	2	6	108	113	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	99077903
5	NC_008042	CGG	2	6	119	124	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	99077903
6	NC_008042	CA	3	6	164	169	50 %	0 %	0 %	50 %	99077903
7	NC_008042	CTCA	2	8	176	183	25 %	25 %	0 %	50 %	99077903
8	NC_008042	GAG	2	6	294	299	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	99077903
9	NC_008042	CTT	2	6	320	325	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	99077903
10	NC_008042	TCG	2	6	411	416	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	99077903
11	NC_008042	AAC	2	6	417	422	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	99077903
12	NC_008042	TATC	2	8	513	520	25 %	50 %	0 %	25 %	99077903
13	NC_008042	GCC	2	6	551	556	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	99077903
14	NC_008042	CGG	2	6	575	580	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	99077903
15	NC_008042	GCCG	2	8	584	591	0 %	0 %	50 %	50 %	99077903
16	NC_008042	CGC	3	9	611	619	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	99077903
17	NC_008042	CCAGCA	2	12	757	768	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	99077903
18	NC_008042	CGA	2	6	812	817	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	99077903
19	NC_008042	CGAC	2	8	838	845	25 %	0 %	25 %	50 %	99077903
20	NC_008042	ACG	2	6	886	891	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	99077903
21	NC_008042	ACG	2	6	943	948	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	99077903
22	NC_008042	CTGC	2	8	966	973	0 %	25 %	25 %	50 %	99077903
23	NC_008042	AC	3	6	994	999	50 %	0 %	0 %	50 %	99077903
24	NC_008042	TC	3	6	1013	1018	0 %	50 %	0 %	50 %	99077903
25	NC_008042	GCA	2	6	1020	1025	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	99077903
26	NC_008042	CT	3	6	1065	1070	0 %	50 %	0 %	50 %	99077903
27	NC_008042	CGG	2	6	1115	1120	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	99077903
28	NC_008042	ACC	2	6	1149	1154	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	99077903
29	NC_008042	TGG	2	6	1162	1167	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	99077903
30	NC_008042	CGA	2	6	1255	1260	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	99077903
31	NC_008042	GACGGC	2	12	1278	1289	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	99077903
32	NC_008042	ACGCC	2	10	1366	1375	20 %	0 %	20 %	60 %	99077903
33	NC_008042	GTG	2	6	1401	1406	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	99077903
34	NC_008042	CGA	2	6	1430	1435	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	99077903
35	NC_008042	GC	3	6	1494	1499	0 %	0 %	50 %	50 %	99077903
36	NC_008042	TGG	2	6	1502	1507	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	99077903
37	NC_008042	CGG	2	6	1541	1546	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	99077903
38	NC_008042	GCGG	2	8	1560	1567	0 %	0 %	75 %	25 %	99077903
39	NC_008042	CAC	2	6	1667	1672	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	99077903
40	NC_008042	CGA	2	6	1675	1680	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	99077903
41	NC_008042	TGC	2	6	1787	1792	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	99077903
42	NC_008042	ACG	2	6	1825	1830	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	99077903
43	NC_008042	CGG	2	6	1850	1855	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	99077903
44	NC_008042	GCG	2	6	1876	1881	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	99077903
45	NC_008042	ACA	2	6	1897	1902	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	99077903
46	NC_008042	CCTGAC	2	12	1946	1957	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	99077903
47	NC_008042	TCGA	2	8	1995	2002	25 %	25 %	25 %	25 %	99077903
48	NC_008042	CAC	2	6	2084	2089	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	99077903
49	NC_008042	GCG	2	6	2124	2129	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	99077903
50	NC_008042	TCG	2	6	2143	2148	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	99077903
51	NC_008042	CCG	2	6	2188	2193	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	99077903
52	NC_008042	GGT	2	6	2201	2206	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	99077903
53	NC_008042	GAT	2	6	2226	2231	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	99077903
54	NC_008042	GCAA	2	8	2256	2263	50 %	0 %	25 %	25 %	99077903
55	NC_008042	CGG	2	6	2296	2301	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	99077903
56	NC_008042	ATG	2	6	2305	2310	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	99077903
57	NC_008042	CCAG	2	8	2341	2348	25 %	0 %	25 %	50 %	99077903
58	NC_008042	ATT	2	6	2349	2354	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	99077903
59	NC_008042	GCG	3	9	2359	2367	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	99077903
60	NC_008042	TCGA	2	8	2415	2422	25 %	25 %	25 %	25 %	99077903
61	NC_008042	CGG	2	6	2429	2434	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	99077903
62	NC_008042	GCG	2	6	2458	2463	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	99077903
63	NC_008042	ACG	2	6	2493	2498	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	99077903
64	NC_008042	TAG	2	6	2527	2532	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	99077903
65	NC_008042	CAG	2	6	2581	2586	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	99077903
66	NC_008042	ACG	2	6	2722	2727	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	99077903
67	NC_008042	TGG	2	6	2744	2749	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	99077903
68	NC_008042	ACAA	2	8	2940	2947	75 %	0 %	0 %	25 %	99077903
69	NC_008042	CAGC	2	8	2956	2963	25 %	0 %	25 %	50 %	99077903
70	NC_008042	CCA	2	6	2980	2985	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	99077903
71	NC_008042	CAA	2	6	3062	3067	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	99077903
72	NC_008042	TGGC	2	8	3073	3080	0 %	25 %	50 %	25 %	99077903
73	NC_008042	TCG	2	6	3088	3093	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	99077903
74	NC_008042	AGGCG	2	10	3164	3173	20 %	0 %	60 %	20 %	99077903
75	NC_008042	TC	3	6	3335	3340	0 %	50 %	0 %	50 %	99077903
76	NC_008042	CT	3	6	3351	3356	0 %	50 %	0 %	50 %	99077903
77	NC_008042	CCTGAC	2	12	3377	3388	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	99077903
78	NC_008042	GGC	2	6	3413	3418	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	99077903
79	NC_008042	GGC	2	6	3426	3431	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	99077903
80	NC_008042	GCC	2	6	3546	3551	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	99077903
81	NC_008042	ATG	2	6	3556	3561	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	99077903
82	NC_008042	CCG	2	6	3667	3672	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	99077903
83	NC_008042	CGC	2	6	3694	3699	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	99077903
84	NC_008042	CAT	2	6	3845	3850	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	99077903
85	NC_008042	CGG	2	6	3851	3856	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	99077903
86	NC_008042	GCC	2	6	3873	3878	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	99077903
87	NC_008042	GAT	2	6	3894	3899	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	99077903
88	NC_008042	CAC	2	6	3932	3937	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	99077903
89	NC_008042	CTG	2	6	3943	3948	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	99077903
90	NC_008042	CGC	2	6	3974	3979	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	99077903
91	NC_008042	GCC	2	6	3983	3988	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	99077903
92	NC_008042	GGC	2	6	3993	3998	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	99077903
93	NC_008042	GCCG	2	8	4007	4014	0 %	0 %	50 %	50 %	99077903
94	NC_008042	TCA	2	6	4096	4101	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	99077903
95	NC_008042	AC	3	6	4114	4119	50 %	0 %	0 %	50 %	99077903
96	NC_008042	CACGG	2	10	4223	4232	20 %	0 %	40 %	40 %	99077903
97	NC_008042	TGC	2	6	4282	4287	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	99077903
98	NC_008042	GAT	2	6	4319	4324	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	99077903
99	NC_008042	CAC	2	6	4385	4390	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	99077903
100	NC_008042	ATC	2	6	4524	4529	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	99077903
101	NC_008042	CGT	2	6	4568	4573	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	99077903
102	NC_008042	GCG	2	6	4585	4590	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	99077903
103	NC_008042	GAT	2	6	4614	4619	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	99077903
104	NC_008042	ACC	2	6	4621	4626	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	99077903
105	NC_008042	CGG	2	6	4631	4636	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	99077903
106	NC_008042	GATCG	2	10	4652	4661	20 %	20 %	40 %	20 %	99077903
107	NC_008042	TGA	2	6	4670	4675	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	99077903
108	NC_008042	CGG	2	6	4712	4717	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	99077903
109	NC_008042	CGG	2	6	4739	4744	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	99077903
110	NC_008042	CAT	2	6	4760	4765	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	99077903
111	NC_008042	ACGGAT	2	12	4884	4895	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	99077903
112	NC_008042	ACG	2	6	4959	4964	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	99077903
113	NC_008042	GCC	2	6	4972	4977	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	99077903
114	NC_008042	TGC	2	6	5056	5061	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	99077903
115	NC_008042	GGA	2	6	5066	5071	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	99077903
116	NC_008042	CG	3	6	5154	5159	0 %	0 %	50 %	50 %	99077903
117	NC_008042	GAT	2	6	5163	5168	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	99077903
118	NC_008042	CGA	2	6	5216	5221	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	99077903
119	NC_008042	AG	3	6	6611	6616	50 %	0 %	50 %	0 %	99077904
120	NC_008042	GAA	2	6	6629	6634	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	99077904
121	NC_008042	GAAG	2	8	6676	6683	50 %	0 %	50 %	0 %	99077904
122	NC_008042	T	7	7	6689	6695	0 %	100 %	0 %	0 %	99077904
123	NC_008042	ACCA	2	8	6768	6775	50 %	0 %	0 %	50 %	99077904
124	NC_008042	GGATTG	2	12	6778	6789	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	99077904
125	NC_008042	AGC	2	6	6809	6814	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	99077904
126	NC_008042	GAC	2	6	6857	6862	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	99077904
127	NC_008042	GAC	2	6	6953	6958	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	99077904
128	NC_008042	GGC	2	6	6960	6965	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	99077904
129	NC_008042	ACA	2	6	6993	6998	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	99077904
130	NC_008042	ATT	2	6	7007	7012	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	99077904
131	NC_008042	CGA	2	6	7069	7074	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	99077904
132	NC_008042	GTGAG	2	10	7092	7101	20 %	20 %	60 %	0 %	99077904
133	NC_008042	GGC	2	6	7124	7129	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	99077904
134	NC_008042	AGC	2	6	7160	7165	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	99077904
135	NC_008042	GCA	2	6	7347	7352	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	99077904
136	NC_008042	GCC	2	6	7476	7481	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	99077904
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398	NC_008042	CGA	2	6	32115	32120	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	99077920
399	NC_008042	CGCCTC	2	12	32127	32138	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	99077920
400	NC_008042	TCG	2	6	32173	32178	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	99077920
401	NC_008042	CAT	2	6	32390	32395	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	99077920
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403	NC_008042	CGC	2	6	32409	32414	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	99077920
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